Julie Deter

Associate Professor at the University of Montpellier

Email: julie.deter (at) univ-montp2.fr

Phone: +33 4 67 14 40 67

Fax: +33 4 67 14 40 61


I was first interested in health ecology, and especially emerging zoonotic diseases. I applied various tools like spatial and statistical analyses, population genetics, immunogenetics, modelling and controlled infections to multi-scale studies (parasite and host individuals, populations and communities) in transmission ecology. Since 2010, I developp research activities in marine ecology at Andromède océanologie. Since 2012, I share my work time between teaching (especially for the master “ecology and biodiversity” ), research within BioDIcée team and private research at Andromède Océanologie. I am interested in the impact of human activities (anthropogenic pressures) on coastal marine biodiversity through the richest habitats of Mediterranean sea: coralligenous reefs (reefs built by sciaphilic algae and fixed animals between -12 and -120) and Posidonia oceanica seagrass beds (marine meadows constituted by a protected marine plant, between 0 and -40 m). I am a professional diver (classe IIB).

Some of my results and data are vailable on the cartographic platform medtrix (www.medtrix.fr) especially in the projects « RECOR », « TEMPO », « IMPACT », « SURFSTAT », « MER-VEILLE » or on the OSU OREME website (https://oreme.org/services/observation/dynalit/coralligene) in the TO « coralligene »

Since 2016, the team BioDICée is involved in the common laboratory « Air to Sea » with Andromède Océanologie. The objective is to develop new methods for the study of marine seabed.





25) Deter J., Lozupone X., Inacio A., Delaruelle G., Holon F. 2017. Boat anchoring pressure on coastal seabed: quantification and bias estimation using AIS dat. Marine Pollution Bulletin 123(1-2) 175-181.

24) Tribot A.S., Mouquet N., Villéger S., Raymond M., Hoff F., Boissery P., Holon F., Deter J. 2016. Taxonomic and functional diversity increase the aesthetic value of coralligenous reefs. Scientific Reports 6, 2016 Article number: 34229. doi:10.1038/srep34229

23) Doxa A., Holon F., Deter J., Villeger S., Boissery P., Mouquet N. 2016. Mapping biodiversity in three-dimensions challenges marine conservation strategies: the example of coralligenous assemblages in North-Western Mediterranean Sea. Ecological indicators. 61(2): 1042-1054.

22) Holon F., Boissery P., Guilbert A., Freschet E., Deter J. 2015. The impact of 85 years of coastal development on shallow seagrass beds (Posidonia oceanica L. (Delile)) in South Eastern France: a slow but steady loss whithout recovery. Estuarine Coastal Shelf Science. In press.

21) Holon F., Mouquet N., Boissery P., Bouchoucha M., Delaruelle G., Tribot A.-S., Deter J. 2015. Fine-scale cartography of human impacts along French coasts: a relevant map for the management of marine ecosystems. Plos One. 10(8): e0135473.

20) Campagne C.-S., Salles J.-M., Boissery P., Deter J. 2015. The seagrass Posidonia oceanica : ecosystem services identification and economic evaluation of goods and benefits. Marine Pollution Bulletin. 97(1-2): 391-400.

19) Coreau A., Conversy P., Bechet A., Billé R., Boisvert V., Bretagnolle V., Delay B., Deter J., Doré A., Doussan I., Dupouey M.-A., Gauthier O., Gosselin F., Halpern C., Jolivet S., Lecomte J., Lefeuvre C., Marty P., Mermet L., Michel C., Poinsot C., Séon-Massin N., Tatoni T., Thevenin E, Touroult J. 2015. Quelles questions émergentes pour les politiques publiques de biodiversité en France métropolitaine ? Résultats et perspectives. Nature, Sciences et Sociétés. 3 : 1-9.

18) Deter J., Descamp P., Ballesta L., Boissery P., Holon F. A preliminary study toward an index based on coralligenous assemblages for the ecological status assessment of Meditteranean French coastal waters. Ecological Indicators. 2012. 20: 345-352

17) Deter J., Descamp P., Boissery P., Ballesta L., Holon F. A rapid photographic method detects depth gradient in coralligenous assemblages. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 2012. 418_419. 75-82

16) Descamp P., F. Holon, L. Ballesta, A. Guilbert, M. Guillot, P. Boissery, V. Raimondino and J. Deter. “Fast and easy method for seagrass monitoring: application of acoustic telemetry to precision mapping of Posidonia oceanica beds”. Marine Pollution Bulletin. 2011. 62 (2) 284-292.

15) Deter J., S. Lozach, A. Véron, J. Chollet, A. Derrien and D. Hervio-Heath. “Ecology of pathogenic and non-pathogenic Vibrio parahaemolyticus on the French Atlantic coast. Effect of temperature, salinity, turbidity and chlorophyll a.” Environmental Microbiology. 2010. 12 (4): 929-937.

14) Deter J., S. Lozach, A. Véron, J. Chollet, A. Derrien and D. Hervio-Heath “Cholorophyll a might structure a community of culturable potentially pathogenic Vibrionaceae. Insights from a one-year study of water andmussels surveyed on the French Atlantic coast.” Environmental Microbiology Reports 2010. 2 (1): 185-191.

13) Charbonnel, N., J. Bryja, M. Galan, J. Deter, C. Tollenaere, Y. Chaval, S. Morand and J.-F. Cosson. “Negative relationship between cellular immune response, MHC class II heterozygosity and secondary sexual character in the montane water vole” Evolutionary Applications 2010.3 (3): 279-290.

12) Deter, J., M. Galan, N. Charbonnel. and J.-F. Cosson. “Characterization and PCR multiplexing of polymorphic microsatellite loci in the whipworm Trichuris arvicolae, parasite of arvicoline rodents and their cross-species utilization in T. muris, parasite of murines.” Molecular & Biochemical Parasitology 2009. 167 (2): 144-146.

11) Charbonnel, N., J. Deter, Y. Chaval, J. Laakkonen, H. Henttonen, L. Voutilainen, O. Vapalahti, A. Vaheri, S. Morand and J.-F. Cosson.“Serological evidence of viruses naturally associated with the fossorial water vole Arvicola scherman (Rodentia, Cricetidae, Arvicolinae) in Eastern France”. Vector-Borne and Zoonotic Diseases 2008. 8 (6): 763-767.

10) Deter J., Y. Chaval, M. Galan, H. Henttonen, J. Laakkonen, L. Voutilainen, A. Plyusnin, B. Gauffre, S. Morand, N. Charbonnel and J.-F. Cosson. “Kinship and dispersal: role in hantavirus transmission in bank and common voles.” Archives of Virology 2008. 153 (3): 435-444.

9) Deter, J., J. Bryja, Y. Chaval, M. Galan, H. Henttonen, J. Laakkonen, L. Voutilainen, O. Vapalahti, A. Vaheri, A. Ribas Salvador, S. Morand, J.-F. Cosson and N. Charbonnel. “Association between the DQA MHC class II gene and Puumala virus infection in the specific reservoir Myodes glareolus, the bank vole.” Infection, Genetics and Evolution 2008. 8 (4): 450-458.

8) Deter, J., N. Charbonnel, J.-F. Cosson and S. Morand. “Regulation of vole populations by the nematode Trichuris arvicolae: insights from modelling.” European Journal of Wildlife Research 2008. 54 (1): 60-70.

7) Cosson, J. F., Bryja, J., Deter, J., Galan, MChaval, Y., Henttonen, H., Hugot, J. P., Michaux, J. R., Morand, S. and Charbonnel, N. “Susceptibility to hantavirus infection and MHC class II gene diversity in rodents” Infection, Genetics and Evolution 2008. 8 (4): S19-S19.

6) Charbonnel, N., Y. Chaval, K. Berthier, J. Deter, S. Morand, R. Palme and J.-F. Cosson. “Stress and demographic decline: a potential effect mediated by impairment of reproduction and immune function in fluctuating water vole populations.” Physiological and Biochemical Zoology 2008. 81 (1): 63-73.

5) Tollenaere, C., Bryja, J., Galan, M., Cadet, P., Deter, J., Chaval, Y., Berthier, K., Salvador, A. Ribas, Voutilainen, L., Laakkonen, J., Henttonen, H., Cosson, J. -F., Charbonnel, N. “Multiple parasites mediate balancing selection at two MHC class II genes in the fossorial water vole: insights from multivariate analyses and population genetics”. Journal of Evolutionary Biology 2008. 21 (5): 1307-1320.

4) Deter, J., Y. Chaval, M. Galan, K. Berthier, A. Ribas Salvador, C. Feliu, S. Morand, J.-F. Cosson, and N. Charbonnel. “Linking demography and host dispersal to Trichuris arvicolae distribution in a cyclic vole species.” International Journal for Parasitology 2007. 37 (7): 813-824.

3) Deter, J., Y. Chaval, J.-F. Cosson, N. Charbonnel and S. Morand. “The intestinal nematode Trichuris arvicolae affects the fecundity of its host, the common vole Microtus arvicolae” Parasitology Research 2007. 101 (4): 1161-1164.

2) Plyusnina, A., J. Deter, N. Charbonnel, J.-F. Cosson, A. Plyusnin. “Puumala and Tula Hantaviruses in France.” Virus Research 2007.129 (1): 58-63.

1) Deter, J., K. Berthier, Y. Chaval, J.-F. Cosson, S. Morand and N. Charbonnel. “Influence of geographical scale on the detection of density dependence in the host-parasite system, Arvicola terrestris and Taenia taeniaeformis.” Parasitology 2006. 132 (4): 595-605.


Book chapters

6) Deter, J. 2014. « Evolution à long terme des herbiers de posidonie » dans Petit traité de séduction à l’usage des amoureux de la Méditerranée. P. Descamp (Eds). Andromède collection, 2014, 152 pages

5) Deter, J., N. Charbonnel and J.-F. Cosson. 2010. “Evolutionary landscape epidemiology” dans The biogeography of host-parasite interactions. S. Morand, Krasnov B. (Eds). Oxford 2010, Oxford University Press

4) Morand, S. and J. Deter. “Parasitism and regulation of the host population” p 83-106 dans Ecology and Evolution of Parasitism. F. Thomas, Guégan J.-F., Renaud F. (Eds). Oxford 2009, Oxford University Press, 240 pages

3) Charbonnel N. and J. Deter (C. Gabrion pour la conclusion). “Parasitisme” p 67-78 dans Le campagnol terrestre. Prévention et contrôle des populations. Delattre P., P. Giraudoux (Eds), Versailles 2009, éditions Quae, 263 pages

2) Giraudoux P, N. Charbonnel, J. Deter, Y. Chaval, J.-F. Cosson and F. Raoul. “Maladies transmissibles à l’homme” p 101-110 dans Le campagnol terrestre. Prévention et contrôle des populations. Delattre P., P. Giraudoux (Eds), Versailles 2009, éditions Quae, 263 pages

1) Morand, S. and J. Deter. “Parasitisme et régulation des populations hôtes (cours biologie LMD)” p13-56 dans Ecologie et évolution des systèmes parasites F. Thomas, Guégan J.-F., Renaud F. (Eds). 2007, De Boeck Université, 428 pages


Ph.D. students

* Guilhem Marre (2017-2020) with S. Luque (Funding cifre): Use of photogrammetry for the monitoring of marine habitats and sub-marine structures

* Adrien Inacio (2017-2020) with V. Dufour (funding Agence de l’eau RMC / Région Occitanie) : Influence of anthropogenic pressures and environmental variables on Posidonia oceanica seagrass bed in French mediterranean sea

* Anne-Sophie Tribot (2014-2017) with N. Mouquet (Funding Fondation de France): Aesthetics and biodiversity of marine landscapes

* Florian Holon (2013-2015) with N. Mouquet (funding : Andromède océanologie/LabEX Cemeb): Interactions between marine ecosystems and anthropogenic pressures. Applications for costal water monitoring and management in Mediterranean sea. (PDF in french : https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01279487/)


M.Sc. students

*Adrien Inacio (M2 de La Rochelle en 2016) avec S. Kéfi (UMR ISEM), accueil Andromède océanologie-UM, financement Andromède océanologie/UM : vers la mise en place d’indicateurs spatiaux de pressions antropiques pour les herbiers sous-marins

*Amandine Zambelli (M2 de l’Université d’Aix-Marseille en 2016) avec F. Rossi (UMR MARBEC), accueil UM, financement MARBEC : lien entre la faune associée aux herbiers à Posidonia oceanica et état écologique de l’écosystème. Focus sur l’herbivorie

*Xavier Lozupone (M2 de l’universite de Strasbourg) avec F. Holon, accueil Andromède océanologie, financement Andromède océanologie : cartographie automatique des habitats marins côtiers Méditerranéens et estimation de la pression de mouillage de la grande plaisance. Encadrement de la partie « pression de mouillage »

*Anne-Sophie Tribot (M2 de l’UM en 2014), avec N. Mouquet, M. Raymond (UMR ISEM) et F. Hoff (Ludiformation), accueil Andromède océanologie-UM, financement Andromède océanologie/UM : relation entre biodiversité et esthétique des récifs coralligènes

*Thomas Pavy (M2 de l’université de Brest en 2013) avec F. Holon, accueil Andromède Océanologie, financement Andromède Océanologie : cartographie 3D et calcul de biomasse des récifs coralligènes entre Menton et Cavalaire-sur-mer

*Guillaume Cornette (M2 de l’école polytechnique fédérale de Lausanne en 2013) avec F. Holon, accueil Andromède Océanologie, financement Andromède Océanologie : complexité structurale du coralligène estimée par traitement d’image

*Carole-Sylvie Campagne (M1 de l’UM en 2013) avec J.-M. Salles (UMR LAMETA), accueil Andromède Océanologie, financement Andromède Océanologie/Agence de l’eau : évaluation économique des biens et avantages tirés des services écosystémiques rendus par les herbiers de Posidonie en France

*Audrey Pedoussaut (DU de l’Université d’Aix-Marseille en 2012), accueil Andromède océanologie, financement Andromède Océanologie : calcul d’indicateurs surfaciques à partir de cartographies et photographies sous-marines



Around 100 hour per year principally with master students (In french) specialised in Ecology, Energy, water environment or aquatic ressources

Responsable des unités d’enseignements « gestion de projets », « gestion de projets et d’activités en entreprise », ‘Innovation », « ecologie urbaine »

Participation aux UE : masteriales, professionnalisation, traçabilité des espèces en milieu naturel